Еще не разбирался с аварийным остановом и как он реализован, но с общих позиций -тормозные резисторы использовали?
Энергии нужно куда-то деваться, рекуперации, насколько мне известно в C2000 нет...
Без резисторов частотник либо останавливается по перенапряжению в звене постоянного тока, либо тормозит, как может, не укладываясь во времена , в зависимости от настроек.